QMİ hələ [[SSRİ]] dövründə İslamı[[İslam]]ı təmsil edən 4 regional dini qurumdan biri idi. [[Mərkəzi Asiya]] və [[Qazaxıstan]] (qərargahı [[Daşkənd]]də), Rusiyanın[[Rusiya]]nın Avropa hissəsi və [[Sibir]] (qərargahı [[Ufa]]da), [[Şimali Qafqaz]] (qərargahı [[Mahaçqala]]da) və [[Zaqafqaziya]] (qərargahı [[Bakı]]da) müsəlmanları ruhani idarələri də SSRİ ilə birlikdə süqut etdi. Lakin məzh [[Azərbaycan]] dövlətinin dəstəyi və ŞeyxulislamŞeyxülislam [[Allahşükür Paşazadə]]nin şəxsi nüfuzu sayəsində 1992-ci ildə Şimali Qafqaz və Zaqafqaziya dini idarələri vahid qurumda – '''Qafqaz Müsəlmanları İdarəsi'''ndə birləşdilər.<ref>[http://ahlibeyt.az/news/a-235.html Azərbaycan və İslam bu gün]. ahlibeyt.az {{az}}</ref>
